鹅源星状病毒（goose astrovirus, GoAstV）是国内新发雏鹅痛风病病原，为更好地应用于临床检测，本试验针对GoAstV分别建立了基于TaqMan探针和SYBR GreenⅠ染料的2种实时荧光定量PCR方法，并比较两者的优劣。首先根据GoAstV的ORF1b基因保守序列设计特异性引物和探针，通过优化反应条件和反应体系，分别建立TaqMan和SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法，并对其进行特异性、敏感性、重复性测定和临床样品检验。结果显示，2种方法均能特异性检测GoAstV,Ct值在质粒标准品浓度2.5×10~2～2.5×10~8 copies/μL范围内线性关系良好，相关系数均为0.999;探针法和染料法的最低检测限分别为2.5×10~1,2.5×10~2 copies/μL;2种方法重复性试验组内与组间变异系数均小于2.50%。对近1年收集的71份临床疑似样本进行检测，探针法和染料法的阳性检出率分别为49.30%和42.25%,探针法的检出率较高。结果表明，本试验建立的TaqMan探针和SYBR GreenⅠ染料荧光定量PCR方法均具有特异性强、敏感性高、重复性好优点，可应用于临床GoAstV的检测，其中尤以TaqMan探针法的灵敏度较高。