普通野生稻被公认为栽培稻的祖先。蕴藏着栽培稻没有或少有的优异基因。因此。保护和利用普通野生稻资源。对丰富栽培稻的遗传基础、保障我国粮食安全具有重要意义。
　　近年来，由于栖息地日益遭受破坏。普通野生稻正面临着野外灭绝的威胁。鉴于野生稻资源的濒危状况，我国农业部于2010年启动了普通野生稻原生境保护工作。截至2007年底，已建立普通野生稻原生境保护点15个。然而，目前已建立的普通野生稻原生境保护点主要是依靠科学家的经验判断和各省上报材料进行选择的，这些被选居群是否合理尚未进行科学验证。
　　《作物学报》2009年第35卷第8期发表的论文《中国普通野生稻(Oryza rufioogon Graft.)原生境保护与未保护居群的遗传多样性比较》就这一问题进行了研究。研究人员通过SSR分子标记方法，对15个原生境保护居群和在我国野生稻分布区内按照纬度划分后随机挑选的15个未保护居群的普通野生稻材料进行遗传多样性分析。结果显示：保护居群和随机挑选的未保护居群在24个基因位点上及居群水平上的有效等位基因数。香农指数和预期杂合度等遗传多样性参数的差异不显著，说明保护居群可以代表我国普通野生稻的遗传多样性状况。保护居群的特有等位变异数远大于未保护居群。表明保护居群保护了更多的特殊基因，具有较高的保护价值。
　　地理来源分析发现15个保护居群涵盖了我国普通野生稻分布区内所有已知的典型地理类型。表明我国普通野生稻原生境保护居群具有典型性。由此可以看出，我国已建立的15个普通野生稻原生境保护点的选择是科学合理的。对我国普通野生稻遗传结构的分析，建议下一步开展的普通野生稻原生境保护点建设应以广西南部及广东为主。
　　该研究的创新之处在于对全国范围内普通野生稻原生境保护居群遗传多样性状况进行了系统研究。其研究结果对判断我国普通野生稻原生境保护居群的典型性和代表性有重要意义，也为野生植物原生境保护和监测提供科学依据。