【摘 要】
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为了研究木枣枣果成熟时由青果向红果转变的分子机理,本研究使用Illumina高通量测序平台对木枣和其衍生种大木枣白熟期青果和全红期红果进行转录组测序分析.经过测序共得到Cl
【机 构】
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延安大学生命科学学院,陕西省红枣重点实验室,延安,716000;延安市技术转移中心,延安,716000
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为了研究木枣枣果成熟时由青果向红果转变的分子机理,本研究使用Illumina高通量测序平台对木枣和其衍生种大木枣白熟期青果和全红期红果进行转录组测序分析.经过测序共得到Clean Data 80.12 Gb,各样品Clean Data平均为6.68 Gb,GC含量为45.00％,Q 30＞93.63％,与参考基因组的比对效率在79.97％～86.44％之间,共发掘1 631个新基因.样品间共筛选出4 905个差异表达基因,其中有8个差异表达基因是所有样品组合共有的.全红期红果与白熟期青果(R vs.G)组合注释到各数据库的DEG基因数(3 278)明显多于其他3个组合,木枣与大木枣白熟期青果(MG vs.DG)间的DEG基因数(1 285)多于全红期红果(MR vs.DR)间的DEG基因数(857).枣果在白熟期和红果期发育阶段的差异表达基因参与了细胞发育、代谢过程及单一生物学过程,并具有较好的结合能力和催化活性,主要参与α-亚麻酸代谢,半乳糖代谢,光合作用-天线蛋白质等代谢途径.同时,还预测检测到2 982个转录调控因子,归于转录因子(TF,1 298)、转录调节子(TR,368)、蛋白激酶(PK,1 316)3大类,分别以AP2-EREBP家族(112)、mTERF家族(46)、RLK-Pelle家族(1 050)的基因最多.该转录组测序分析结果为寻找枣果由白熟期向全红期转变的相关基因提供理论参考.
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