犬细小病毒主要蛋白基因同义密码子偏爱性分析

来源 :石河子大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tongxu1
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犬细小病毒是一种对犬科动物危害严重的DNA病毒,为了解其主要蛋白的密码子使用特点,本文运用EM—BOSS(The European Molecular Biology Open SoftwareSuite)的CHIPS和CUSP程序、Codonw在线软件对CPV全基因组及3种主要蛋白基因的有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、碱基含量(GCa11、GC1、GC2、GC3)进行分析。结果显示:CPV基因组、Nsl、VPl、VP2基因的Nc值分别为36.46、37.86、35.05和32.
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