洛阳地区5种嗜尸性麻蝇分子鉴定研究

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目的 应用经典DNA条形码和28S rRNA基因鉴定洛阳地区5种常见嗜尸性麻蝇种属,评价其在常见嗜尸性麻蝇种属鉴定中应用的可行性.方法 收集洛阳地区常见嗜尸性麻蝇类标本18只,经形态学分类鉴定后,Chelex-100法提取足部DNA,扩增并测序线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)和28S核糖体核糖核酸(28S rRNA)基因片段,BLAST比对后,与来自DNA条形码数据库(Barcode of Life Data,BOLD)的中国和韩国地区20条相应蝇种序列进行比对,用MEGA 7.0软件整理分析所得序列,计算碱基组成、种内及种间进化分歧率,并构建系统发育树.结果 形态学鉴定18只嗜尸性麻蝇归于3属5种.每个样本获得COI和28S rRNA的扩增长度分别为646bp和721bp.在线BLAST比对结果显示样本COI序列相似度99%以上,邻近法构建发育树Bootstrap值为1000,5种麻蝇可以较好聚类,与形态学鉴定结果一致.38个样本COI种内范围为0~0.022,棕尾别麻蝇、酱亚麻蝇和急钩(亚)麻蝇种间范围在0.057~0.090;赤尾麻蝇和红尾粪麻蝇种间范围在0~0.086.5种麻蝇的28S rRNA序列发育树显示,棕尾别麻蝇和急钩(亚)麻蝇明显各自聚类,其余3种成一类.结论 对于本研究中的5种嗜尸性麻蝇,基于COI基因的DNA条形码可以有效区分棕尾别麻蝇、酱亚麻蝇和急钩(亚)麻蝇,28S rRNA基因只可以区分棕尾别麻蝇,二者可作为形态学鉴定之外的重要方法补充.
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