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基于ProteinGoggle 2.0的组蛋白H4蛋白质变体的自上而下表征

来源 :色谱 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yht52119

【摘 要】

：

由于大量可能蛋白质变体以及每一个翻译后修饰大量可能位点的存在,核心组蛋白上密集的组合式翻译后修饰的自上而下表征一直是一个巨大的分析挑战。结合高分辨串级质谱,基于同

【作 者】

：

肖开捷 田志新 

【机 构】

：

同济大学化学科学与工程学院、上海市化学品分析、风险评估与控制重点实验室

【出 处】

：

色谱

【发表日期】

：

2016年12期

【关键词】

：

ProteinGoggle 2.0 自上而下 组蛋白H4 蛋白质变体 ProteinGoggle 2. 0  top-down  histone H4  pro 

【基金项目】

：

National Natural Science Foundation of China（No.21575104）, China State Key Basic Research Program（No.2013CB911203）, Shanghai Science and Technology Commission（No.14DZ2261100）

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由于大量可能蛋白质变体以及每一个翻译后修饰大量可能位点的存在,核心组蛋白上密集的组合式翻译后修饰的自上而下表征一直是一个巨大的分析挑战。结合高分辨串级质谱,基于同位素质荷比和轮廓指纹比对的整体蛋白质数据库搜索引擎ProteinGoggle 2.0在组蛋白翻译后修饰的自上而下鉴定方面拥有诸多独特的优势。该文报道ProteinGoggle 2.0对HeLa核心组蛋白H4的数据库搜索及蛋白质变体的鉴定结果。基于从UniProt网站下载的人类核心组蛋白H4的纯文本文件和＂鸟枪法＂注释,ProteinGoggle

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