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传统的两阶段工作流工作模式严重阻碍了工作流柔性的提高，从生物适应的角度，提出了一种基于动态实例的柔性工作流建模模式，该模式下的工作流模型能够通过在不同环境中的实例实现工作流柔性；给出了该模式下柔性工作流活动的可扩展属性、方法和动态控制连接弧等的形式化描述；基于自主计算技术引入了嵌入柔性工作流活动的自主元模型，使用基于加权因子的可信度方法对自主元的推理知识表达，提高了柔性工作流的智能性；给出了动态实例建模模式柔性工作流完备性原则；最后给出了一个柔性工作流建模和自主元知识推理的实例，并对实例的完备性进行了分析