【摘 要】
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为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus（SCSMV）不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律,本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列,通过生物信息学分析
【机 构】
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扬州大学园艺与植物保护学院,中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室,云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室
【基金项目】
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植物病虫害生物学国家重点实验室开放课题（SKLOF201518）, 扬州大学科技创新培育基金（2015CXJ043）
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为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus（SCSMV）不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律,本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列,通过生物信息学分析,分别从重组、系统发生、选择压力等方面研究SCSMV HC-Pro基因的分子变异特征。共测定了44条SCSMV HC-Pro基因序列,相似性最低值为70%;HC-Pro基因重组频率较低,仅发现3个重组位点,其中一个系首次报道;与先前报道相比,部分新测定云南蔗区的SCSMV分离物在HC-
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