【摘 要】
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为了在基因组水平上调查大围子猪群体遗传结构及遗传多样性,本研究利用RAD-seq简化基因组测序技术鉴定480份大围子猪样本中SNP位点的分布,计算近交系数、观测杂合度、两两样本间遗传相关系数,构建系统发育树,进行主成分分析,解析大围子猪的遗传结构及遗传多样性。结果显示:在大围子猪上鉴定出高质量的SNP位点387 935个,1号染色体上SNP数量最多(27 906个),Y染色体上SNP数量最少(1
【基金项目】
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湖南省重点实验室开放研究基金项目(2017TP1030); 湖南省重点研发计划项目(2019NK2193;2020NK2024); 湖南省生猪产业技术体系建设项目;
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为了在基因组水平上调查大围子猪群体遗传结构及遗传多样性,本研究利用RAD-seq简化基因组测序技术鉴定480份大围子猪样本中SNP位点的分布,计算近交系数、观测杂合度、两两样本间遗传相关系数,构建系统发育树,进行主成分分析,解析大围子猪的遗传结构及遗传多样性。结果显示:在大围子猪上鉴定出高质量的SNP位点387 935个,1号染色体上SNP数量最多(27 906个),Y染色体上SNP数量最少(1 143个);大围子猪群体中标记杂合度在0.3~0.4之间,且群体平均观测杂合度(0.201 4)低于平均期望杂合度(0.213 0),群体近交系数为0.029 84;大围子猪群体中除少许样本未出现聚类现象外,可以明显分成13个类群,且群体中没有出现显著的群体分离现象。综上所述,大围子猪群体血统纯正,具有丰富的遗传多样性;群体内近交程度较低,且群体内遗传变异高于品种间的变异。本研究为下一步大围子猪的保种和选育提供了一定的参考依据。
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