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针对于传统DEA交叉效率评价方法的局限性,本文在引入锥比率DEA模型和熵权法的基础上,提出了基于偏好锥DEA模型的交叉效率评价方法,优化了具有偏好的决策单元间自评价和他评价之间的融合问题。将该方法应用于项目风险评估,给出了一种风险评估方法,实现了决策单元的全排序。最后通过算例比较,表明了该方法的有效性。