【摘 要】
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基于shotgun混合蛋白质鉴定思路,研究山羊角水提液中蛋白质类、肽类物质组成。采用超高分辨的线性离子阱-静电场轨道阱质谱（LTQ/Orbitrap MS）,从山羊角水提液中大于3ku部位鉴定
【机 构】
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南京中医药大学,江苏省海洋药用生物资源研究与开发重点实验室,江苏省方剂高技术研究重点实验室
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基于shotgun混合蛋白质鉴定思路,研究山羊角水提液中蛋白质类、肽类物质组成。采用超高分辨的线性离子阱-静电场轨道阱质谱（LTQ/Orbitrap MS）,从山羊角水提液中大于3ku部位鉴定出52个蛋白质,从小于3ku部位鉴定出1 288个肽段,这些肽段源于46个蛋白质。鉴定出的蛋白质主要为角蛋白、胶原蛋白、角蛋白相关蛋白等结构蛋白。根据每个氨基酸出现的频次,将蛋白质上的肽段标记,绘制热图（heat map）,据此推测山羊角水提液中多肽类物质形成的过程为：从蛋白质的热区（hot regions）中经过降
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