植物基因序列组
　　
　　在2009年，科学家们成功绘制出了黄瓜、高粱和两种玉米的基因序列图谱，这是非常值得庆贺的事。木薯和油棕榈树的基因图谱也已经被绘制出来了，虽然可能没有《科学》杂志预测的那么多，但是还有不少其他植物的基因序列研究也取得了一定进展。
　　
　　海洋酸化
　　
　　由于大气层二氧化碳含量的不断增加，海洋不可避免的酸化趋势在2009年引起了公众更多的关注，但是意料之中的是关注度并不是很高。而对生物普遍有不良影响的坏消息接踵而来却是可以预期的。关于特别快速的酸化等热点问题也层出不穷，但是并没有什么真正引起全世界的共同关注。在哥本哈根举行的全球气候协商也尚未对唯一确定的温室效应问题取得任何进展。
　　
　　神经系统科学在法庭上的应用
　　
　　2009年3月。南加利福尼亚州一宗儿童抚养权案中的被告律师提交了一份功能磁共振成像(fMRI)扫描图作为证据。据称，这份扫描图可以显示案件中的被告所讲的都是事实，但后来这份证据被撤销了。同年11月，伊利诺伊州一位已经被判有罪的谋杀犯的律师使用fMRI扫描图辩称被告应该被免除死刑，因为扫描图显示被告的大脑功能紊乱失调。经过深思熟虑，陪审团还是做出了决定。在法庭上使用神经成像作为证据的案例越来越多，但2009年并不像我们预测的那样成为具有转折性的一年。
　　
　　哥本哈根之路
　　
　　新任美国总统保证通过温室气体排放限制条例，国际力量的不断增长，以及越来越明晰的气候科学也许已经为在丹麦举行的联合国会议铺平了道路。大会议题是要签署历史性的气体排放全球协议。但是美国参议院和国际谈判代表在会议举行之前无法取得一致意见，因此会议在公之于众后取消了。气体排放限制议题将在2010年重新提上日程。但是即将到来的美国国会大选以及华盛顿持续的党派之争将成为任何全球协议的主要障碍。
　　
　　黑暗初现端倪
　　
　　正如人们所预测的，黑暗物质仍然不为人所知。两年前，航空航天技术情报中心(ATIC)的气球实验发现太空中的一股特殊能量中存在过量电子和阳电子，这也许是黑暗物质粒子之间互相消灭的表象。但是在2009年费米伽马射线太空望远镜的绕轨道运行过程中并没有发现这些过多电子。虽然费米频谱并不完全像天体物理学家所预期的那样，但是根据轨道上PAMELA粒子探测仪得到的数据显示，阳电子与电子的比例确实有所增加。
　　
　　物种定义
　　
　　如果达尔文知道在他200岁诞辰的2009年。我们在物种形成的遗传基因学领域所取得的进展，他一定会感到很高兴的。依据物种形成基因的定义方式，以及对哺乳动物、酵母菌和果蝇的研究发现，物种形成基因的数量已经从2006年的5种发展到现在的大约15种。另外，研究学者们成功地确定了其他一些DNA。包括多个有助于定义新物种的调整领域，同时，他们也致力于研究基因组如何影响物种形成。
　　
　　粒子加速器的成功
　　
　　虽然我们并没有如预料之中的那样发现希格斯玻色子(Higgs boson)，但是美国伊利诺伊州费米国家加速器实验室的核粒子加速器不可不谓成功。美国能源部宣布将在2011年前运行正负质子对撞机，这样就可以使费米实验室的物理学家们发现最梦寐以求的粒子的存在。或者推断出这种粒子最有可能在哪些物质中存在。欧洲粒子物理实验室、欧洲粒子物理研究所(CERN)、日内瓦附近以及瑞士的物理学家。终于成功启动了更具威力的大型强子碰撞型加速装置(Large Hadron Collider)，因此寻找希格斯粒子的竞赛很有可能推迟到2012年了。