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试验以云南三台核桃幼叶为试材提取基因组DNA，并用正交设计方法，比较了Taq酶、Mg^2＋、引物、dNTPs和DNA模板等5因素5水平共25个反应体系的ISSR—PCR扩增结果。确定三台核桃ISSR-PCR的反应体系为：20μL反应体系中Taq酶0．25U、Mg^2＋。为2．0mM／L、引物0．8μM／L、dNTPs0．4mM／L、10×PCR Buffer 2μL和10ng模板DNA。该体系的建立为今后利用ISSR技术进行三台核桃遗传图谱的构建、基因定位、种质资源鉴定与分类和遗传多样性分析奠定