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DNA甲基化是真核生物表观遗传学重要的机制之一，对基因转录水平的表达具有重要的调控作用。近年来，DNA甲基化在动植物遗传育种领域的研究引起了人们广泛的关注。我们从DNA甲基化与基因的表达调控、动植物基因组的甲基化状态、甲基敏感扩增片段多态性方法、DNA甲基化与杂种优势，以及DNA甲基化与分子标记等方面，简要综述了国内外有关DNA甲基化在动植物遗传育种研究中的进展，着重于全基因组DNA甲基化模式在动植物遗传育种中的相关研究和应用。