木本油料文冠果APETALA2基因全长cDNA序列与生物信息学分析

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文冠果是我国北方特有的木本油料树种。AP2是植物种子发育调控的重要转录因子。根据已获得的文冠果转录组数据搜索文冠果AP2基因序列(XsAP2),并对XsAP2基因全长cDNA序列进行生物信息学分析。结果表明,XsAP2基因cDNA序列包含1个长度为1548bp的完整ORF,编码515个氨基酸。XsAP2蛋白大部分区域为亲水区,由136个倩螺旋、89个延伸链、43个β-转角、247个无规则卷曲构成。依据2gcc.1.A同源建模法,获得1个三级结构模型,该模型从第153个氨基酸开始到第213个氨基酸结束。Xs
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