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“双一流”建设是我国高等教育改革发展的主旋律,在此背景下,高校跨学科建设迎来了新的发展机遇和挑战。学科间价值取向不一、院系间环境推力微弱、院校内组织构建单一、校内外制度设计滞后等问题制约了高校跨学科建设进程。提出高校应从厚植价值底蕴、营造环境氛围、增进组织模式以及创新制度保障方面提高跨学科建设水平。