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在量子动力学计算中，有时候为了规避奇点问题或者节省计算量，我们经常需要对哈密顿量进行变换．然而，在使用傅里叶基矢计算时，哈密顿量的变换形式容易导致哈密顿矩阵失去厄米性，进而有些情况下使数值计算变得不稳定．本文主要讨论构建具有厄米性的哈密顿算符的方法．以三原子分子为例，构建了键长一键角和Radau坐标下描述分子运动的各种形式的哈密顿量．基于这些哈密顿量，采用含时波包方法计算了OC10分子的吸收光谱，讨论了非厄米性矩阵对计算结果的影响．本文所得到的结论对基于基函数展开的量子动力学计算都是适用的．