猪链球菌2型98HAH33株脂蛋白的in silico方法鉴定

来源 :河南科技大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:q3821713
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为鉴别已公布基因组序列的SS2 98HAH33株的脂蛋白,以研究脂蛋白在SS2致病过程中的作用,首先利用PrositeScan和DOLOP脂蛋白预测软件预测98HAH33株的脂蛋白,采用SignalP 3.0HMM,PrediSi,Phobius和LipoP—HMM分析预测的脂蛋白的信号肽,然后经“多数票决法”鉴定脂蛋白,最后利用InterProScan和BlastP服务器对鉴定的脂蛋白进行功能分析。结果鉴定出31种脂蛋白,占SS2致病株98HAH33蛋白质组的1.465%。功能分析结果表明,共有16种脂
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