东北大口鲇2个群体的微卫星DNA多态分析(英文)

来源 :遗传学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jijipanji
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
利用磁珠富集法克隆制备的24个大口鲇(Silurus meriaionalis Chen)微卫星标记,对黑龙江野生群体与松花江养殖群体2个东北大口鲇(S.soldatovi)的地理种群的等位基因频率(P)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)等进行了遗传检测,以遗传偏离指数(d)检验Hardy-Weinberg平衡,并以Nei氏遗传分化系数(GST)和AMOVA分析(φST)群体遗传变异的来源。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏遗传距离的个体间UPGMA系统树。结果表明:24个微卫星标记在东北大口鲇的2个群体中共扩增出1357条多态性片段,片段长度为102-385 bp,总体平均等位基因8.875个,可以用于东北大口鲇遗传多样性的评估。并发现8个可区分这2个种群的遗传标记;黑龙江群体的P、Ho、He、PIC和Ne依次为0.165、0.435、0.758、0.742和5.019,松花江群体为0.147、0.299、0.847、0.764和5.944,在这些多样性参数上,方差分析也显示2地理种群差异不显著,在大多数位点并无显著差异,仅HLJcf37位点具有显著差异;在多个位点偏离Hardy-Weinberg平衡,2群体呈现不同程度的杂合体过度,纯合体完全缺失现象,其原因有待证实;群体遗传变异分析证实2群体间遗传分化较弱,其98%以上的变异是由群体内个体间的遗传变异引起的,群体间的变异对总变异影响不显著。UPGMA系统树也显示出个体间遗传距离小,亲缘关系很近。结果表明,人工繁殖没有对东北大口鲇的遗传多样性产生影响,该种群遗传分化小,种质资源状况良好。 Microsatellite DNA markers of 24 Silurus meriaionalis Chen prepared by magnetic bead enrichment method were used to analyze the allele frequencies of the geographic populations of two S. sodicatovi populations in Heilongjiang and Songhuajiang aquaculture populations (He), polymorphism information content (PIC) and number of effective alleles (Ne) were detected by genetic analysis, Hardy-Weinberg The sources of population genetic variation were analyzed by Nei’s genetic differentiation coefficient (GST) and AMOVA (φST). At the same time, phylogeny UPGMA phylogenetic trees based on Nei’s genetic distance were mapped using PHYLIP3.63 software. The results showed that a total of 1357 polymorphic fragments were amplified from 24 microsatellite markers in two populations of N. maculata, with a length of 102-385 bp and an overall average of 8.875 alleles, which could be used in the northeast big mouth鲇 Assessment of genetic diversity. And found 8 genetic markers that could distinguish the two populations; P, Ho, He, PIC and Ne of Heilongjiang were 0.165, 0.435, 0.758, 0.742 and 5.019 respectively, The population was 0.147,0.299,0.847,0.764 and 5.944. On these diversity parameters, ANOVA also showed that there was no significant difference between the two geographical populations, and there was no significant difference in most loci, Only HLJcf37 loci have significant differences; at a number of loci deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium, two groups showed varying degrees of heterozygosity, complete loss of homozygotes, the reason to be confirmed; population genetic variation analysis confirmed that genetic differentiation between two groups Weak, more than 98% of the variation is caused by the genetic variation among individuals in the population, and the variation among the groups has no significant effect on the total variation. The UPGMA phylogenetic tree also shows that individuals have small genetic distances and are closely related. The results showed that artificial propagation had no effect on the genetic diversity of Pinctada inhabits in Northeast China. The genetic differentiation of the population was small and germplasm resources were in good condition.
其他文献
水合肼是一种精细化工产品,近年来市场需要迅速增长。该产品广泛地用之于农药、医药、塑料、助剂等行业。株化集团公司研究院经过近四年多的不断摸索和实验,在取得小试数据的基
结合小波变换及字典学习提出了一种针对高光谱图像的压缩算法。该算法首先通过小波变换构建多尺度样本集,在小波域使用K-均值奇异值分解(K-SVD)方法学习得到原子尺寸不同的多尺度字典,然后在稀疏表示的过程中,定义一个原子使用频次筛选因子,通过统计局部最优波段稀疏表示时原子使用情况,结合筛选因子对字典原子进行优化筛选,使用精简后的字典对其余波段进行稀疏求解,最后针对不同尺度的表示系数采用自适应的量化编码
We proposed a wide spectrum and rapid calculation model FALTRAN( Fast Atmospheric Limb TRANsmission),to solve the problems of current radiative transfer model i
期刊
利用风云三号卫星搭载的紫外臭氧总量探测仪(TOU)和国际同类卫星的臭氧总量数据对1979年—2011年北半球春季臭氧特征进行了分析,发现北极臭氧年际变化显著,它与平流层温度变化一致(相关系数为0.75)。北极臭氧损耗异常强弱年的月均和日变化特征有明显差异,春季北极臭氧损耗强年有明显的化学损耗过程(1997年和2011年),而弱年化学作用影响不明显(1999年和2010年)。损耗弱年的日变化型在不同
大气水汽对全球以及区域气候变化有重要的影响,精确获取水汽数据是非常重要的研究方向。TRMM(热带降雨观测计划)卫星上搭载的VIRS传感器(可见光/红外扫描仪)在降雨观测中应用广泛
地表温度是区域和全球尺度地表物理过程的一个重要参数,目前已有的地表温度产品空间分辨率较低,缺乏高空间分辨率的地表温度产品。Landsat系列卫星提供了大量免费的高空间分辨率遥感数据,然而对应的高空间分辨率地表温度产品还未见到,为了获取长时间序列的高空间分辨率地表温度数据,针对Landsat 8 TIRS数据提出了一个物理单通道地表温度反演算法。该算法首先利用ASTER全球地表发射率产品(ASTER
2014年,世界香料香精的销售额约为280亿美元,其中西欧占30%,北美占23%,中国占17%,日本占7%,其他地区占23%。就香料和香精中不同产品的消费情况看,香料销售额占行业总销售额的
由于法规压力,以及消费者对天然产品和产品透明度的需求不断提高,2014年全球发展中国家的香料香精市场继续减速增长。2014年原料价格的问题要比2013年略有好转。公司不断的收
为研究慢性肾功能不全长期进程及其肾功能改变提供可靠的定量形态学依据。方法 应用光镜电镜半薄、超薄连续切片和体视学定量分析方法 ,对锂导致大鼠慢性肾功能不全的肾小球