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在国库集中支付制度改革前．农业综合开发资金实行的县级财政报账制，采用由市级财政局国库科或内设在财政局的农业综合开发办计财科（资金科）下拨到县级财政部门农财股，由农财股在银行设立专户、开设专账，实行“专人管理，专账核算，专款专用”的三专管理，在资金使用上．由项目建设单位或施工单位凭农发部门初审认定的技术，结算资料．报财政部门农财股和分管副局长审批后，支付相关款项。