【摘 要】
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目的 通过生物信息学方法,分析阿司匹林抗结直肠癌的作用机制.方法 在DrugBank 5.1.5中查找阿司匹林的直接作用蛋白靶点(direct protein targets,DPTs);构建阿司匹林DPTs的蛋白质-蛋白质相互作用(pro-tein-protein interaction,PPI)网络并分析相关信号通路;从GEO数据库中获取结直肠癌表达谱芯片数据,筛选中心度最高的20个结直肠癌差异表达基因作为Hub基因;将DPTs相互关联基因与结直肠癌Hub基因求交集,确认阿司匹林抗结直肠癌的潜在作用靶
【机 构】
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南方医科大学南方医院 广州 510515
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目的 通过生物信息学方法,分析阿司匹林抗结直肠癌的作用机制.方法 在DrugBank 5.1.5中查找阿司匹林的直接作用蛋白靶点(direct protein targets,DPTs);构建阿司匹林DPTs的蛋白质-蛋白质相互作用(pro-tein-protein interaction,PPI)网络并分析相关信号通路;从GEO数据库中获取结直肠癌表达谱芯片数据,筛选中心度最高的20个结直肠癌差异表达基因作为Hub基因;将DPTs相互关联基因与结直肠癌Hub基因求交集,确认阿司匹林抗结直肠癌的潜在作用靶点,分析其在TCGA数据库结肠腺癌样本中的表达情况,并进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析.最终通过RT-PCR和WB实验验证阿司匹林抗结直肠癌的潜在靶点.结果 在DrugBank 5.1.5中确定了11个阿司匹林DPTs,KEGG信号通路分析发现其中6个DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2,TP53)与癌症的发生发展有关.将DPTs相关联基因与筛选的20个结直肠癌Hub基因求交集,发现5个基因(CDK1,AURKA,CCNB1,MAD2L1,TPX2)可能是阿司匹林抗结直肠癌的潜在作用靶点,其在TCGA数据库结肠腺癌样本中均表达上调,基因功能主要富集于细胞周期调控.RT-PCR和WB实验结果显示阿司匹林可以降低人结肠癌细胞中CDK1,AURKA,CCNB1,MAD2L1,TPX2的mRNA水平和蛋白表达.结论 CDK1,AURKA,CCNB1,MAD2L1,TPX2可能是阿司匹林抗结直肠癌的潜在靶点,其可能通过影响细胞周期调控发挥抗肿瘤作用.
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