目的:分析比较不同临床标本微生物检验的阳性率测定结果。方法:选取2017年1月至2017年6月接受检验的13000例患者的临床标本为对照组,另选取2017年6月至2017年12月接受检验的15000例患者的临床标本作为观察组,两组患者均接受微生物检验,标本包括血液、呼吸道分泌物、非呼吸道分泌物(伤口分泌物、穿刺液、尿液等)、粪便,对两组患者的微生物标本进行检验,检验过程均以标准化规定为依据进行操作,对不同时间段患者临床标本微生物检验的阳性率结果进行对比分析。结果:观察组中,血培养阳性率为17.31%,呼吸道标本阳性率为10.22%,非呼吸道标本阳性率为30.94%,粪便标本阳性率为11.67%;对照组中,血培养阳性率为14.29%,呼吸道标本阳性率为7.18%,非呼吸道标本阳性率为26.89%,粪便标本阳性率为4.0%。经统计学分析,观察组临床标本微生物检验的阳性率均明显高于对照组,差异具有统计学意义(P <0.05)。结论:不同时间段检测不同临床标本微生物的结果存在一定差异性,根据检测结果汇总不同临床标本微生物检验阳性率有差异的原因,可为疾病的临床诊断和预后评估提供客观、准确的依据。