【摘 要】
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隐马尔可夫模型是对DNA序列建模的一种简单且有效的模型,实际应用中通常采用一阶隐马尔可夫模型.然而,由于其一阶无后效性的特点,一阶隐马尔科夫模型无法表示非相邻碱基间的
【基金项目】
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国家自然科学基金（61175123）
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隐马尔可夫模型是对DNA序列建模的一种简单且有效的模型,实际应用中通常采用一阶隐马尔可夫模型.然而,由于其一阶无后效性的特点,一阶隐马尔科夫模型无法表示非相邻碱基间的依赖关系,从而导致序列中一些有用统计特征的丢失.本文在分析DNA序列特有的生物学构造的基础上,提出一种用于DNA序列分类的二阶隐马尔可夫模型,该模型继承了一阶隐马尔可夫模型的优点,充分表达了蕴涵在DNA序列中的生物学统计特征,使得新模型具有明确的生物学意义.基于新模型,提出一种DNA序列的贝叶斯分类新方法,并在实际DNA序列上进行了实验验证.
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