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为了研究制造信息系统自组织过程中的宏观相对稳定性与微观单元之间互作用的关系，提出了制造企业复杂信息系统自组织过程结构模型，建立了单元的自动机模型和单元的状态转换函数，以及单元之间交互的接口模型、单元之间的映射耦合函数以及单元属性的本体描述，建立了伺服约束函数模型，研究宏观序参量对单元自作用和互作用的伺服作用，并进行了系统仿真。该模型体系可以准确表述自组织过程、揭示自组织规律，分析制造信息系统静态功能结构和动态运行特性。