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国家南方农药创新中心由各具专业特色的上海基地、江苏基地、湖南基地和浙江基地组成,分别依托于上海市农药研究所、江苏省农药研究所、湖南省化工研究院和浙江省化工研究院。作为国家“九五”科技攻关的重点项目,经过5年的建设和运行,国家南方农药创制中心已经通过了验收,并被评为科技部、财政部、国家计委、国家经贸委的“九五”国家重点科技攻关计划优秀科技成果。