【摘 要】
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蔷薇科桃属植物长柄扁桃Amygdalus pedunculata Pall.是我国重点发展的12种木本油料作物之一.将自然生长在陕西省榆林市毛乌素沙地的长柄扁桃进行高通量测序、组装得到了GenB
【机 构】
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河南科技大学农学院,河南洛阳471003;榆林学院生命科学学院,陕西榆林719000
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蔷薇科桃属植物长柄扁桃Amygdalus pedunculata Pall.是我国重点发展的12种木本油料作物之一.将自然生长在陕西省榆林市毛乌素沙地的长柄扁桃进行高通量测序、组装得到了GenBank登录号为MG602257的长柄扁桃叶绿体基因组.与NCBI中其他两个长柄扁桃叶绿体基因组(MG869261和KY101153)进行序列比对发现:长柄扁桃叶绿体基因组均呈现典型的4分区域结构;基因组序列GC含量均是36.8％;总长度MG602257＜MG869261＜KY101153,分别为157 851 bp、157 873 bp和157 948 bp;3个叶绿体基因组存在149个突变位点,包括93次替换事件、56次插入缺失事件、无小倒位事件.长柄扁桃叶绿体基因组密码子数目和RSCU值偏性分析具有极高的相似性.3个长柄扁桃叶绿体基因组在JLB/JSB/JSA/JLA四个边界有相同的基因类型和排列顺序,但在LSC/IRa边界JSA中,ndhF基因在MG602257和MG869261中的总长度相同,而在KY101153中总长度增加9 bp;ycf1基因横跨IRb/SSC边界区,基因长度在MG602257、MG869261和KY101153中分别为5 657、5 588、5 684 bp,是造成全叶绿体基因长度差异的因素之一.基于全叶绿体基因组序列构建的系统发育进化树显示,3个长柄扁桃序列和一个榆叶梅序列聚在同一分支,说明榆叶梅和长柄扁桃亲缘关系较近.研究结果为长柄扁桃的叶绿体转基因工程、种质资源开发应用提供了基础实验数据.
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