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海洋功能区划制度是我国海洋综合行政管理的一项制度和法律，对我国海洋保护、使用和管理起到了十分重要的作用，对我国海洋的可持续发展具有重大的历史意义，对世界海洋管理理论也是一重大贡献。但是，海洋功能区划的体系和理论还不完善。文章对海洋功能区划的理论、实践和思想的矛盾做了初步探讨，对管理范围、海洋功能、海域区划、社会需求、社会发展和应用等方面的矛盾做了分析，对海洋功能区划的变革做了初步讨论。