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长乐-南澳构造带中发育有晚侏罗世早期、晚侏罗世晚期及早白垩世等3个不同时期的变质变形侵入岩。不同期次侵入岩具有不同的变质变形特征。根据糜棱岩的空间分布、糜棱叶理的切割关系等，表明构造带在中生代发生了3期韧性剪切变形及相关的动力变质作用。第一期为（北西西－南东东向）右行－推覆韧性剪切，具低角闪岩相变质、深部构造层次长石相塑性变形等特征；第二期为（北北西－南南东向）左行－逆冲韧性剪切，具高绿片岩相变质、中深层次长石－石英相塑性变形的特征；第三期为具正断层性质的右行走滑韧－脆性剪切（主剪切面倾向反转为倾向南东）