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生态系统服务功能在研究道路交通工程的生态影响方面有着重要的作用，尤其是对于存在交通穿越的饮用水水源保护区的生态系统影响评价。以深圳东部某高速公路设置开口为研究对象，计算公路开口带来的生态系统服务功能（包括调节气候、固碳释氧、土壤保持、涵养水源、净化环境、减弱噪声、农业生产直接经济价值、物种保育8个方面）损失。在此基础上，结合环境污染损失、经济社会效益和工程建设费用进行了损益综合分析，以全面评估饮用水水源保护区公路开口的生态系统影响。结果表明，该穿越水水源保护区的高速公路开口设置方案对于生态系统的影响很大，