作为一种极具观赏与收藏价值的有机宝石，琥珀不同于其他宝石的珍贵之处还体现在它的科学价值上。通过对琥珀内含物的研究，科学家们得出的成果甚至可以刷新人类对地球的认知。
　　远古羽毛
　　2011年，加拿大阿尔伯塔大学古生物学家赖安·麦凯勒发现11种包含羽毛的琥珀样本，其中一个羽毛样本中包含着具有规则间距的中空绒丝，直径大约16微米。它很可能是一种远古鸟类或恐龙身上的羽毛。
　　早期昆虫伪装
　　2012年，巴塞罗纳大学的研究人员在西班牙境内发现了1.1亿年前的昆虫琥珀样本，这是迄今发现最早的昆虫伪装证据。这种昆虫是现代草蛉的远古近亲，像现代草蛉一样，它将植物细丝缠绕在自己身体上，形成一个突起物，试图隐藏在掠食者的视线之中。
　　侏儒蝗虫
　　多明尼加共和国最重要的琥珀样本之一就是新发现的远古物种侏儒蝗虫，它是英国博物学家大卫·阿登堡发现的。这个侏儒蝗虫样本和玫瑰花刺大小相近，形成于2 000万年前的中新世。这枚琥珀具有重要价值，它证实了蝗虫进化的过渡类型。
　　最古老的莱姆病毒
　　由于琥珀可以完好地保存软体组织，科学家收集了大量的显微等级样本，其中包括保存在较大生物体内的细菌。近年来，俄勒冈州立大学研究人员对多米尼加共和国的琥珀样本进行了分析，发现远古扁虱感染莱姆病毒细菌的历史可追溯至2 000万年前。
　　最古老的节肢动物
　　2012年，科学家宣布在意大利东北部发现一枚琥珀，里面完好地保存着两种类型的螨虫。这枚毫米等级的琥珀中的节肢动物的历史可追溯至2.3亿年前，比之前发现的最早的节肢动物样本早1亿年。经鉴别，这两种螨虫是现代瘿螨的远古近亲。
　　恐龙时代的开花植物
　　2014年，缅甸科学家对一枚保存完好的白垩纪早期琥珀样本进行了研究，在琥珀中发现18朵小花，其中有一朵正在制造新种子，其历史可追溯至1.1亿年前。这项发现验证了恐龙时代开花植物的多样性。
　　正在攻击黄蜂的蜘蛛
　　在1亿多年前的白垩纪时期，一只蜘蛛正准备扑向困在蜘蛛网上的雄性黄蜂，突然一滴树脂从高处落下，正好击中蜘蛛。2012年，考古学家在缅甸胡康谷发现了这枚琥珀，经鉴别，这只蜘蛛是现已灭绝的圆蛛。
　　上亿年前的花朵
　　2017年，古生物学家在缅甸发现数块封存着花朵的琥珀，这些花朵约1亿年前被固定在古松树的树脂里。
　　美国俄勒冈州立大学的乔治·波纳尔说：“这些琥珀把花朵的资料保存下来，它们看起来就像刚从花园里摘下来的一样。或许是从花朵旁走过的恐龙偶然将它们折断，让它们落进南洋杉的树脂里。人们认为南洋杉成就了大部分史前琥珀，现在南洋杉属植物主要生长在新西兰和澳大利亚。”
　　缅甸的森林里曾生长着类似现代澳洲南洋杉一樣的树，这让缅甸与多米尼加岛、波罗的海国家一同成为琥珀化石的主要来源地之一。