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文章以技术创新体系中具有创新源动力的高校作为研究主体,对长三角区域82所高校进行科技创新绩效评价,研究发现在既定的技术水平上,有更多高校资源的使用效率达到最优状态,但没有达到科技创新的最优规模,规模效率低是引起综合效率未达到有效的主要原因,更进一步的原因可能是大部分高校的科研投入存在不同程度的冗余,科技成果质量和成果转化方面也可能存在无效问题。在此基础上,文章试图构建高校协同创新的理论机制,使高校主动及时协同区域发展战略及企业需求,并扩大智力资本优势,彰显高校科技创新多方协同的研究特色,以高校科技创新助力国家整体创新水平的提升。