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通过对HS3D数据集供点序列碱基的统计分析，利用供体位点邻域碱基出现规律构造模式（motif）作为DNA序列的属性。设置序列属性值将字符序列映射成数字向量，应用支撑向量机进行实验，实现对供体位点的预测分类。实验结果表明，与改进的motif得分模型方法相比，该文方法可有效去除数据中异常数据对分类的影响，将DNA字符序列变换到motif属性数字序列空间具有有效性和实用性。