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为探究GnRH1基因多态性与奶牛繁殖性状、产奶性状和热应激抗性的关系，本研究基于70头中国荷斯坦公牛的DNA混池测序，对GnRH1基因全序列及上下游2 000 bp进行SNP位点扫描，在外显子2上发现1处同义突变位点g.72735118A＞G，采用竞争性等位基因特异性PCR（KASP）技术对1 160头泌乳期健康荷斯坦牛中进行SNP分型，并采用GLM模型对SNP位点g.72735118A＞G与繁殖、产奶和热应激反应性状的育种值进行关联分析。群体遗传学分析显示，位点g.72735118A＞G符合哈代温伯格平衡，基因型AA、AG和GG的频率分别为0.48、0.44和0.08，最小等位基因频率为0.30，多态性信息含量为0.42。关联分析表明，位点g.72735118A＞G与初产日龄、首次配种受胎率、产犊至首次配种间隔、青年牛和经产牛首末次配种间隔等繁殖性状极显著相关，与头胎产奶量、乳脂量和乳蛋白量等产奶性状极显著相关，同时与直肠温度极显著相关。位点g.72735118A＞G的不同基因型中，GG型个体的头胎产奶性状和繁殖性状均表现更优，但抗热应激能力较差；然而，AA型个体的产奶性状和繁殖性状表现较差，但抗热应激能力更强。综上，GnRH1基因是中国荷斯坦牛繁殖性状的重要候选基因，同时在奶牛的乳腺发育和体温调节上发挥着重要作用，可根据育种目标将SNP位点g.72735118A＞G作为分子遗传标记应用于中国荷斯坦牛的分子育种。