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医师绩效考核是医院加强医师管理，提高医师执业水平的有效方法。绩效考核流程涉及多职能科室，需要大量业务数据上报，并不断改进考核指标，这些都给考核工作带来困难。文章通过对考核业务流程分析，利用信息系统原型开发方法，以HIS为基础，设计了可配置的医师绩效考核系统。该系统可通过HIS自动获取部分客观绩效考核指标，并实现考核指标可配置、SQL语句可配置、数据项可配置等软件配置功能。软件可配置的功能可适应考核需求的变化，提高系统的灵活性。通过该医师绩效考核系统的应用，提高了考核工作效率和考核标准的一致性，考核指标的可