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期刊论文
数据压缩在序列比对中的应用
数据压缩在序列比对中的应用
来源 :计算机工程与应用 | 被引量 : 0次 | 上传用户:daweihu2009
【摘 要】
:
同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具“超级压缩比对”(简称SCA),该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比
【作 者】
:
杜娟
呼广跃
【机 构】
:
天津城市建设学院
【出 处】
:
计算机工程与应用
【发表日期】
:
2008年22期
【关键词】
:
序列比对
Sequitur码
锚定
sequence alignment
Sequitur code
anchor
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同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具“超级压缩比对”(简称SCA),该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比对设计。SCA是一个线性算法,并且能够处理序列重排。实验证明SCA算法能够准确快速的完成长基因组序列的比对。
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