基于微单体型分子标记的草鱼亲子鉴定方法

来源 :水生生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：youtubo

【摘要】

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研究选择一种新型分子标记--微单体型用于亲子鉴定,构建了高效的标记筛选和亲子鉴定流程,并以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为例评估了该亲子鉴定方法的效果。结果表明,利

【作者】

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夏雷石米娟张婉婷段攸程莹寅吴南夏晓勤

【机构】

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中国科学院水生生物研究所,中国科学院科学院大学,中国科学院种子创新研究院

【出处】

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水生生物学报

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

微单体型亲子鉴定草鱼高通量测序 MicrohaplotypePaternity testGrass carpHigh-throughput sequenc

【基金项目】

：

国家自然科学基金(31571275和31801055),中国科学院战略先导专项A类项目子课题(XDA08020201)资助

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研究选择一种新型分子标记--微单体型用于亲子鉴定,构建了高效的标记筛选和亲子鉴定流程,并以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为例评估了该亲子鉴定方法的效果。结果表明,利用基因组重测序数据能够准确完成微单体型标记的分型,效果和适应性明显优于传统的基于群体遗传学推断的分型;通过信息熵的大小能够高效筛选微单体型标记组合, 3个和5个微单体型标记的亲子鉴定结果与微卫星序列(SSR)鉴定结果的一致性分别达到97.08%和99.42%。研究表明使用微单体型分子标记可以快速而准确地完成鱼类的亲子鉴

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