【摘 要】
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【目的】对茎瘤芥根际微生物进行分离鉴定，分析微生物菌群构成，选择具有优良特性的菌株，评估其次级代谢产物合成能力，为茎瘤芥根际微生物多样性和菌种资源的挖掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市涪陵区二渡村和邓家村的茎瘤芥根，分离培养根际微生物菌株，通过菌株形态观察和看家基因的序列分析，对菌株进行初步鉴定、归类和保存。选择具有优良性状的菌株，利用Pacbio RS II和Illumina HiSeq平台完成
【机 构】
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西南大学农业科学研究院生物技术中心
【基金项目】
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重庆市技术创新与应用发展专项项目（cstc2021jscx-cylh X0001）； 西南大学“聚贤工程”启动项目（SWU117015）～～；
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【目的】对茎瘤芥根际微生物进行分离鉴定，分析微生物菌群构成，选择具有优良特性的菌株，评估其次级代谢产物合成能力，为茎瘤芥根际微生物多样性和菌种资源的挖掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市涪陵区二渡村和邓家村的茎瘤芥根，分离培养根际微生物菌株，通过菌株形态观察和看家基因的序列分析，对菌株进行初步鉴定、归类和保存。选择具有优良性状的菌株，利用Pacbio RS II和Illumina HiSeq平台完成全基因组测序，通过antiSMASH分析评估其次级代谢产物合成潜力，克隆目的基因簇并进行异源表达和产物鉴定。【结果】分离得到256株微生物，初步鉴定120株；从中鉴定了一株产紫色杆菌素的杜擀氏菌BjR8，完成了基因组测序及分析，发现该菌基因组为一条环状染色体，全长7 205 593 bp,GC含量为64.67%，含有6 241个编码基因。生物信息学分析发现基因组含有9个次级代谢产物生物合成基因簇，其中7个基因簇与已知化合物编码基因簇同源性较低，说明该菌具有产生多种新型次级代谢产物的潜力；克隆得到紫色杆菌素生物合成基因簇，并在变铅青链霉菌TK23中完成了异源表达。【结论】从茎瘤芥根际分离得到256株微生物，初步分析了茎瘤芥根际的微生物菌群构成；完成了一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的基因组测定与分析，从中克隆了紫色杆菌素基因簇，并成功在链霉菌中实现异源表达。
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