菲律宾网民的看法
　　枪击案发生时正值菲律宾要进行中期选举，菲律宾媒体没有任何报道，大部分转载法新社的通稿；各大媒体评论员也未触及这话题，倒是网民热议跟帖，对菲官方关于此事的诸多说辞表示质疑，批评菲海岸警卫队枪杀渔民立下恶劣先例。
　　有网民表示，即便台湾渔船有意冲撞菲方公务船，也难以对菲方人员构成威胁；即便构成威胁，也不会造成生命威胁。“道个歉为什么这么难？”说句“我们对这起意外事件表示道歉，我们会查出责任人员”又怎样？毕竟，“在联合国或任何法庭，都没有法律会准许枪杀手无寸铁的渔民”。
　　不过，大部分网民还是力挺菲政府的立场：事件发生在菲律宾领海，防卫队是在执行制止非法捕鱼。有的网民愤愤不平，指责台湾和中国大陆一样，都想以“制裁”的手段迫使菲律宾“低头”。对台湾要用经济手段制裁菲律宾，如停止引进菲劳工、抵制菲货或赴菲观光或采用军事手段报复，许多网民认为台湾更需要有技术的菲律宾劳工与看护，并称在台菲律宾劳工工作环境很差，工资被剥削。
　　面对台湾将给予制裁的警告，包括冻结菲劳赴台申请，菲律宾劳工部长发出书面声明回应称，如果遭到台湾制裁，菲方已经备妥应变方案，考虑把外劳转为输出到中东以及韩国等地。
　　台渔民曾多次被扣
　　不过，菲律宾对到巴士海峡捕鱼的台湾渔船一点也不客气，过去发生多起扣押、袭击台湾渔船事件。台菲两地隔着巴士海峡，相距不过240海里。台湾渔船到这个海域进行捕鱼作业，时常要面临被菲律宾公务船攻击的危险。2006年1月，台东渔船“满春亿号”曾遭菲律宾海岸警队开枪射击，船长陈安老不幸中弹身亡。
　　台渔民在巴士海峡捕鱼时遭遇菲方扣押多数以“罚钱”了事。台湾当局始终对菲方强硬不起来，无所作为，事件经常不了了之。菲律宾海岸警队食髓知味，始终认为台湾渔民可欺，遂变本加厉。
　　美国因素
　　近年来阿基诺三世当局配合美国重返亚洲政策，自愿充当马前卒，不断挑衅中国大陆，利用美国的支持镇住国内反对力量，巩固政权。发生惨案地点是菲律宾所声称的经济专属区领海，菲方坚持防卫队是在执行制止非法捕鱼，捍卫主权，美国的支持被认为是菲律宾强硬的原因之一。台湾渔民被枪击事件发生之后，美国国务院的表态敦促双方保持克制，美国自然不希望看到两个盟友闹翻，大打出手，影响到其亚太的布局。
　　分析指出，菲射杀台渔民可达到数项目的：满足菲海岸警卫队不满情绪，收买军心；敲山震虎，威慑台湾，借此宣示菲捍卫领土的决心，将菲推向前峰；激起两岸人民怒火，让阿基诺三世成为全球华人的公敌，使他没有退路，全面倒向美国（这对以拥有华人血统政冶家沾沾自喜者也是一个反讽）。