2株鸡细小病毒全基因组序列测定与分析

来源 :中国兽医杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：stystill

【摘要】

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为了解近年来鸡细小病毒(ChPV)流行毒株的全基因组基因特征和分子进化规律,本研究对2018年从山东潍坊和河南濮阳肠炎综合征病例中检测到的2株ChPV-SDWF和ChPV-HNPY进行了基因

【作者】

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高倩文王君娜张宇名尹燕博徐守振

【机构】

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青岛农业大学动物医学院

【出处】

：

中国兽医杂志

【发表日期】

：

2020年9期

【关键词】

：

鸡细小病毒基因组遗传进化 chicken parvovirus genome genetic evolution

【基金项目】

：

国家重点研发计划(2018YFD0501403),山东省自然科学基金(ZR2016CM08),山东省现代农业产业技术体系家禽创新团队项目(SDAIT-11-03)

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为了解近年来鸡细小病毒(ChPV)流行毒株的全基因组基因特征和分子进化规律,本研究对2018年从山东潍坊和河南濮阳肠炎综合征病例中检测到的2株ChPV-SDWF和ChPV-HNPY进行了基因组克隆和序列测定。应用MEGA 5.02、SimPlot 3.5.1、Phyre 2等生物信息学软件对基因结构、遗传变异、重组情况及VP2蛋白3D结构进行了分析。结果显示,2株分离株基因组序列长度均为4615 bp,核苷酸同源性为96.9%;ChPV-SDWF株和ChPV-HNPY株与不同参考株的核苷酸同源性分别为80

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