bHLH genes polymorphisms and their association with growth traits in the Pacific oyster Crassostrea

来源 :海洋湖沼学报(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:libin101
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The basic helix-loop-helix(bHLH)genes encode a large superfamily of transcription factors in the Pacific oyster(Crassostrea gigas),and play a very important role in regulation of growth and development.To investigate the oyster growth traits and the associations with bHLH genes variations,we analyzed the gene polymorphisms-traits association in a wild population,and confi rmed the results in another independent wild population by targeted gene re-sequencing and SNPshot analysis.After screening the single nucleotide polymorphisms(SNPs)in three candidate genes of the bHLH family(88 bHLH genes in two wild oyster populations in total),we identifi ed the allele CgLoblHLH4-T/G located in the exon of the CgLoblHLH4 gene.This allele is a non-synonymous mutation(Phe/Leu)with an extremely signifi cant association with shell width(P <0.01)and allele G is benefi cial to shell width.This SNP on the CgLoblHLH4 gene might have a potential value as a genetic marker of growth traits that could be used in breeding in C.gigas in the future.
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