Identifying changed protein-protein interactions in biological processes by gene coexpression analys

来源 :中国科学通报：英文版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：mengxiangpiaoxue

【摘要】

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在 2 蛋白质之间的相互作用力量不在不同条件下面不变却可变。为一个给定的生物过程，在相互作用力量经历动态变化的蛋白质蛋白质相互作用(PPI ) 的鉴定以前高度珍贵却从未完成

【作者】

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ZHANG Ting ZHANG XueGong SUN Z

【机构】

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KeyLaboratoryofBioinformaticsofMinistryofEducation,BioinformaticsDivision

【出处】

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中国科学通报：英文版

【发表日期】

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2010年14期

【关键词】

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蛋白质相互作用相互作用力生物过程表达分析基因识别价格指数转化生长因子 protein-protein interaction TGFβ rhe

【基金项目】

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The authors thank ZUO Wei for his helpful suggestions on the research design. We also thank Dr. ZHANG Michael, Dr. SUN FengZhu, Dr. J1ANG Rui, WU XueBing and DU PuFeng for their in-depth discussion, a

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在 2 蛋白质之间的相互作用力量不在不同条件下面不变却可变。为一个给定的生物过程，在相互作用力量经历动态变化的蛋白质蛋白质相互作用(PPI ) 的鉴定以前高度珍贵却从未完成。在这个工作，我们介绍了一条计算途径由分析编码交往的蛋白质对的基因的 coexpression 水平在全球规模上识别改变的 PPI (cPPIs ) 。这条途径源自蛋白质蛋白质相互作用的变化厌烦的生物概念在基因 coexpression 水平的印记。我们使用了这个方法在与 cytokine 对待的房间识别 cPPIs 在风湿性关节炎(R

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