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基因组移位变换中值问题的近似算法
基因组移位变换中值问题的近似算法
来源 :河南大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:anruixiang
【摘 要】
:
讨论基因组在移位变换下的中值问题(TMP).给定m个基因组,每个基因组含N条染色体,TMP问题是求另一个基因组,使该基因组与其它基因组之间的移位距离和最小.对无向模型,用转化为旅
【作 者】
:
王骁力
夏云清
【机 构】
:
南阳师范学院数学与统计学院,中州大学基础科学学院
【出 处】
:
河南大学学报:自然科学版
【发表日期】
:
2011年4期
【关键词】
:
移位距离
中值问题
基因组重构
近似算法
translocation distance median problem genome rearrangement
【基金项目】
:
河南省自然科学基金资助项目(102300410184), 河南省教育厅自然科学基金资助项目(2009B11017), 南阳师院高层次人才科研启动费资助
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讨论基因组在移位变换下的中值问题(TMP).给定m个基因组,每个基因组含N条染色体,TMP问题是求另一个基因组,使该基因组与其它基因组之间的移位距离和最小.对无向模型,用转化为旅行售货员问题的断点中值问题给出其近似解;对有向模型,借助于求图的最大权匹配给出TMP问题的近似算法.
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