毛冠鹿在我国主要分布于西南、华中、华南区域,有三亚种(指名亚种、华中亚种、华南亚种)。为探讨各省头骨性状的差异及各省毛冠鹿亲缘关系,在选取32项较为完整的头骨测量性状的基础上,运用统计分析软件SPSS 11.0对其进行分析,结果推测如下:1)毛冠鹿3个亚种的地位是确定的。2)四川、云南所属指名亚种与重庆、湖北所属华中亚种较近,二者与广东、江西、湖南、浙江所属的华南亚种关系较远。3)在头骨32个性状中,两两亚种之间具有显著差异的性状:指名亚种与华南亚种14个(颅全长、颅基长、基长、基底长、前颌长、吻宽、鼻骨长、鼻骨宽、最小眶间距、眼窝高、腭长、前颌骨内叶长、两上颊齿最大距离、下齿列长);指名亚种与华中亚种2个(吻宽、上齿列长),华南亚种与华中亚种有19个(颅全长、颅基长、基长、基底长、前颌长、额骨长、最小眶间距、眶间宽、枕部最窄、脑颅最大宽、鼻骨宽、泪骨缝长、腭长、颧宽、前颌骨内叶长、上齿列长、两上颊齿最大距离、最小颅高、下齿列长)。