【摘 要】
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目的采用基因甲基化芯片技术筛选抗结核药物性肝损伤(anti-tuberculosis drug induced liver injury,ADLI)患者与非肝损伤患者间DNA差异甲基化基因位点。探讨DNA甲基化与ADLI
【机 构】
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华北理工大学公共卫生学院,河北省煤矿卫生与安全重点实验室; 呼伦贝尔市传染病医院检验科;
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(81670525);华北理工大学研究生创新项目(CXZZBS2017128)~~
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目的采用基因甲基化芯片技术筛选抗结核药物性肝损伤(anti-tuberculosis drug induced liver injury,ADLI)患者与非肝损伤患者间DNA差异甲基化基因位点。探讨DNA甲基化与ADLI发病机制的关系。方法选取2016年1月至2017年7月间唐山市第四医院治疗的肺结核初治患者共137例,分为ADLI组(n=65)、非ADLI组(n=72)。收集研究对象的临床一般资料及全血标本。选择其中14例(7例ADLI,7例非ADLI)患者,提取全血标本的DNA,利用Illumina 850K芯片技术检测病例组和对照组DNA的差异甲基化情况。对芯片筛选出差异较大的甲基化基因DUSP22、HLA-C,进一步在剩余的65例病例组和58例对照组中采用甲基化特异PCR(MSP)方法验证甲基化水平,并采用荧光定量PCR检测DUSP22、HLA-C基因的m RNA水平。结果共检测853 307个CpG位点,病例组和对照组差异显著的位点共1 012个,其中高甲基化位点254个,低甲基化位点758个,主要位于基因体区。聚类分析结果显示,在细胞黏附、金属离子结合等过程中存在大量甲基化差异基因。病例组与对照组人类双特异性磷酸酶DUSP22基因、人类白细胞抗原HLA-C基因的甲基化率差异均有统计学意义(65. 6%vs 36. 9%、37. 9%vs 58. 5%,P <0. 05),对照组中DUSP22 m RNA表达水平高于病例组,而HLA-C m RNA表达水平低于病例组。结论外周血中DUSP22、HLA-C基因DNA甲基化与ADLI的发生相关。
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