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构建科学、合理的科研平台框架和组织运行体系是基地可持续发展的关键要素和基本保障。广东基地在实践中构建了以仪器设备或技术为核心的平台静态结构和以科研团队为核心的动态组织相结合的“二元组织结构模型”，围绕中医药科研创新链的关键环节，搭建系列共性技术平台。通过制订管理制度和完善信息系统，实现平台的开放服务。引入科研团队的概念和形式来统筹和管理平台运作人员，从运行机制改革上探讨了平台在实现服务功能的同时，通过技术创新维持技术优势的可行性，为科研平台和基地可持续运行进行了有益探索。