【摘 要】
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为了挖掘苹果抗白粉病基因,本研究以正常和感染白粉病的两种苹果矮化砧木’T337’和’JM7’为试验材料,利用高通量测序技术对其进行转录组测序后组装,通过GO富集分析和Pathwa
【机 构】
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西南林业大学,云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,昆明,650224;西南林业大学,西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室,昆明,650224
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为了挖掘苹果抗白粉病基因,本研究以正常和感染白粉病的两种苹果矮化砧木’T337’和’JM7’为试验材料,利用高通量测序技术对其进行转录组测序后组装,通过GO富集分析和Pathway功能注释进行与白粉病相关的差异表达基因的筛选,得到可能与抗白粉病相关的基因并了解其表达模式,最后利用qRT-PCR进行验证.分析转录组数据,最终得到13 240条显著差异表达基因,其中包括4 987个’T337’和8 253个’JM7’,且发现相对’T337’材料,’JM7’材料对白粉病刺激的应答反应更敏感,通过通路分析和功能注释共获得了48条与白粉病相关的差异表达基因,最后利用qRT-PCR对10个差异基因进行定量分析,结果表明转录组数据可靠.对苹果矮化砧木进行抗白粉病基因的筛选及分析,并初步对这些差异基因进行功能分析及鉴定,对后期基因克隆及转基因等研究具有重要意义.
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