【摘 要】
:
目的组学数据信息多样且体量庞大,变量间关系错综复杂。相关分析有助于在海量数据间找到有效关联对,是转化医学和系统生物学研究中常用手段之一。元基因组学和代谢组学2大组
【机 构】
:
上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心
【基金项目】
:
国家自然科学基金项目(31501079,31500954,81772530);上海交通大学附属第六人民医院院内预研(2017)
论文部分内容阅读
目的组学数据信息多样且体量庞大,变量间关系错综复杂。相关分析有助于在海量数据间找到有效关联对,是转化医学和系统生物学研究中常用手段之一。元基因组学和代谢组学2大组学平台由于具备整体系统性分析的功能,广泛应用到了菌群和代谢物的相关研究中。元基因组学和代谢组学数据的来源、结构和特点各不相同,需科学选取相关分析方法进行高质量跨组学研究。方法选取4种典型的相关分析方法(2种经典方法和2种元基因组数据专用方法),设计仿真数据集和实验数据集,对各方法的性能进行测试和比较。结果仿真和真实数据结果显示,CCLasso的相关系数最小,误差百分比最大,所找到的相关对数目最少;Spar CC的结果与CCLasso相反;Pearson与Spearman结果介于两者之间,较为中立。结论对于元基因组学与代谢组学数据的相关分析,CCLasso方法较为严格,易得到假阴性结果;Spar CC方法较为宽松,易得到假阳性结果;Pearson和Spearman结果介于两者之间。建议研究者结合研究目标和侧重点确定具体方法。
其他文献
陈旸,福建闽清人,北宋绍圣元年贤良科进士,官至礼部侍郎,所著《乐书》二百卷,具有一定的历史、文化价值。 本文上篇以民族音乐学的视角为切入点,结合其他学科诸如史学、社会学、
学校到工作的过渡是职业技术教育中最为基本的问题之一。20世纪90年代以来,随着青年失业率的不断增长、劳动力市场的变化以及企业界对高素质员工的迫切需求,这一课题越来越成为
目的:探讨颈椎围手术期康复护理的意义价值。方法:对87例患者进行围手术期康复护理,观察20~30天并于出院后6、12个月跟踪访视。结果:5例因呼吸肌麻痹死亡,其中有3例合并坠积性肺炎,2
一直以来,英语作文教学都是初中英语教学的一个重要环节,其在考试中所占的分值比重是比较大的。由于英语作文考查的是学生词汇、语法、句式等各种知识的掌握情况,因此学生要
高校师资队伍中教师流失的情况近年来在全国各地高校中几乎普遍存在,只是因各校所处环境和条件的差异而在程度上有所不同,但就其主要表现来讲,具有一定的共性。WL学院是一所国有
人NDRG2(N-myc downstream regulated gene 2)基因是本研究组用锚定引物PCR方法从正常人脑cDNA文库中克隆得到的一个新基因。基因库登录号为AF159092。NDRG2为NDRG基因家族成
目的观察应用伊托必利联合复方阿嗪米特治疗糖尿病胃轻瘫患者的疗效和安全性。方法将120例患者随机分为2组,伊托必利联合复方阿嗪米特治疗组60例(A组)、多潘立酮联合复方阿嗪米
本文采用调查法,文献资料法,数理统计法,逻辑分析法,以及以福州九中高一年级60名中学生为研究对象的实验法,对我省中学田径教学的现状进行分析,并指出我省中学田径教学的教学指导思
《费加罗的婚礼》是莫扎特最著名的歌剧之一,这部歌剧在音乐创作和社会思想上具有突出的意义,本文主要运用音乐形态学、社会学、音乐美学的方法,以莫扎特歌剧与博马舍戏剧的对照
以一种更具效率的方式加工联轴器,本文所提及的联轴器是一种应用很普遍的梅花联轴器,也叫爪式联轴器,其外形结构比较简单,其端面上有四个凸台。本文制定了梅花联轴器的锻造成