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[目的]掌握2009年云南省“十一五”期间农村饮水安全工程末梢水微生物污染状况，为评价农村饮水安全工程的效果提供科学依据。[方法]根据2009年枯水期与丰水期，抽取云南省“十一五”期间70县农村饮水安全工程末梢水的浑浊度、细菌学指标和消毒剂余留量检测数据，比较不同水期、不同水源类型和不同水处理方式时这些指标的差异。[结果]云南省2009年共检测3242件末梢水，枯水期末梢水的浑浊度、菌落总数、总大肠菌群和耐热大肠菌群合格率均高于丰水期；地下水的浑浊度、细菌学指标及消毒剂余留量合格率均高于地表水；经完全处理