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推进科研事业单位改革,提升科研创新能力,建立规范有效的内部控制制度,对加强自身能力建设,提高综合效能具有现实意义。文章通过对科研事业单位内部控制存在的问题及形成的原因进行分析,重点从制度的顶层设计、构建风险控制机制、完善预算控制、创新内控措施、强化审计监督和实施动态监管等六个方面提出了解决对策和建议,以期对科研事业单位内部控制建设的完善有所帮助。