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目的
筛选免疫性血小板减少症(ITP)患者血浆差异表达微小RNA(miRNA)。
方法收集2012年6月至2013年9月天津市第一中心医院血液科就诊的25例ITP患者及同期20名健康体检者血浆,采用miRNA芯片检测血浆中miRNA表达谱,筛选ITP血浆差异表达的miRNA。通过靶基因预测程序TargetScan和miRanda进行潜在的靶基因预测,并进行基因本体和信号通路注释分析,探索可能与ITP发病相关的基因和信号通路,并用实时(real-time)PCR对差异表达的miRNA进行验证。
结果根据基因芯片结果,发现ITP患者血浆中存在29个差异表达的miRNA,其中上调15个,下调14个,通过靶基因预测程序TargetScan和miRanda预测出608个潜在的靶基因,基因本体分析显示参与生物学过程的基因占78.12%(475/608);参与分子功能的基因占80.76%(491/608);参与细胞组分的基因占87.66%(533/608),富集分析显示P<0.05的基因本体有9个。通路分析显示157个信号通路与608个靶基因相关,富集分析P<0.05的信号通路有25个。其中值得特别关注的信号通路是钙离子信号通路和T细胞受体信号通路。real-time PCR显示ITP患者血浆中miRNA4778-5p、miRNA4800-5p显著高于健康对照,而miRNA4707-5p、miRNA4721、miRNA3620-3p、miRNA378i显著低于健康对照(均P<0.05),与芯片结果一致。
结论miRNA芯片初步筛选出ITP患者血浆miRNA差异表达谱,生物信息学分析提示钙离子信号通路和T细胞受体信号通路可能与ITP患者发病和进展有关。